6 tháng kể từ khi Nagisa trở thành Maeda Atsuko thứ 14 và Chieri trở thành Center Nova, Akb0048 đã tuyển dụng thực tập sinh thế hệ thứ 78. Câu chuyện chủ yếu tập trung vào Nagisa, Chieri và các học viên thứ 78.